Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SV2BQ7L1I2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SV2BQ7L1I2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SV2BQ7L1I2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.4 ms