Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCD1Q6ZMY3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCD1Q6ZMY3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCD1Q6ZMY3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPOCD1Q6ZMY3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPOCD1Q6ZMY3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOCD1Q6ZMY3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms