Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYHR1Q6ZMK1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYHR1Q6ZMK1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYHR1Q6ZMK1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms