Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSMFQ6X4W1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NSMFQ6X4W1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms