Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC5Q6UXY8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC5Q6UXY8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms