Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRAXAS1Q6UWZ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms