Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BLOC1S2Q6QNY1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BLOC1S2Q6QNY1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms