Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6Q795 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6Q795 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6Q795 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6Q795 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6Q795 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6Q795 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6Q795 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6Q795 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Q6Q795 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Q6Q795 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6Q795 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6Q795 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6Q795 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q6Q795 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6Q795 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6Q795 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q6Q795 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6Q795 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6Q795 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q6Q795 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6Q795 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q6Q795 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6Q795 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6Q795 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6Q795 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6Q795 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6Q795 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6Q795 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6Q795 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q6Q795 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q6Q795 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q6Q795 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q6Q795 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q6Q795 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms