Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TXNDC11Q6PKC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC11Q6PKC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms