Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP4Q6PIL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP4Q6PIL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP4Q6PIL6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms