Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ULK3Q6PHR2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ULK3Q6PHR2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms