Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZCCHC12Q6PEW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms