Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC27A4Q6P1M0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC27A4Q6P1M0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A4Q6P1M0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms