Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEPROQ6NW34 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEPROQ6NW34 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms