Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMBOX1Q6NT76 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMBOX1Q6NT76 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms