Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC70Q6NSX1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC70Q6NSX1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms