Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGP8Q6NSW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms