Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD16Q68DU8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD16Q68DU8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCTD16Q68DU8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms