Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YOD1Q5VVQ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YOD1Q5VVQ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms