Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMCO4Q5TGY1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCO4Q5TGY1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO4Q5TGY1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms