Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MARCH8Q5T0T0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCH8Q5T0T0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH8Q5T0T0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH8Q5T0T0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH8Q5T0T0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH8Q5T0T0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH8Q5T0T0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH8Q5T0T0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH8Q5T0T0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH8Q5T0T0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH8Q5T0T0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH8Q5T0T0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms