Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PERM1Q5SV97 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms