Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD4BQ5PRF9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD4BQ5PRF9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD4BQ5PRF9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms