Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPANXN3Q5MJ09 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPANXN3Q5MJ09 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms