Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD3Q5JSP0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD3Q5JSP0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD3Q5JSP0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms