Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LIN52Q52LA3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN52Q52LA3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms