Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM259Q4ZIN3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM259Q4ZIN3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms