Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP13A4Q4VNC1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A4Q4VNC1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms