Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTC1Q2NKJ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms