Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RFX7Q2KHR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFX7Q2KHR2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFX7Q2KHR2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms