Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICBQ29980 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MICBQ29980 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICBQ29980 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICBQ29980 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MICBQ29980 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICBQ29980 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICBQ29980 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICBQ29980 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MICBQ29980 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MICBQ29980 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICBQ29980 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICBQ29980 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICBQ29980 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICBQ29980 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICBQ29980 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICBQ29980 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICBQ29980 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MICBQ29980 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICBQ29980 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICBQ29980 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICBQ29980 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICBQ29980 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICBQ29980 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICBQ29980 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MICBQ29980 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICBQ29980 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICBQ29980 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICBQ29980 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MICBQ29980 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MICBQ29980 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MICBQ29980 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MICBQ29980 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MICBQ29980 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICBQ29980 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICBQ29980 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICBQ29980 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICBQ29980 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICBQ29980 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICBQ29980 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICBQ29980 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MICBQ29980 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICBQ29980 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICBQ29980 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICBQ29980 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICBQ29980 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICBQ29980 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICBQ29980 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MICBQ29980 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MICBQ29980 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICBQ29980 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICBQ29980 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICBQ29980 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICBQ29980 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MICBQ29980 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICBQ29980 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICBQ29980 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICBQ29980 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MICBQ29980 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICBQ29980 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICBQ29980 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICBQ29980 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICBQ29980 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICBQ29980 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICBQ29980 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICBQ29980 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICBQ29980 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MICBQ29980 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICBQ29980 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MICBQ29980 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICBQ29980 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICBQ29980 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MICBQ29980 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICBQ29980 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICBQ29980 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICBQ29980 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MICBQ29980 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICBQ29980 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICBQ29980 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICBQ29980 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICBQ29980 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICBQ29980 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICBQ29980 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICBQ29980 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MICBQ29980 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICBQ29980 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICBQ29980 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MICBQ29980 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms