Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN1Q16799 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RTN1Q16799 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN1Q16799 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RTN1Q16799 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RTN1Q16799 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RTN1Q16799 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN1Q16799 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN1Q16799 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN1Q16799 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN1Q16799 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN1Q16799 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN1Q16799 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN1Q16799 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN1Q16799 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN1Q16799 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN1Q16799 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTN1Q16799 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTN1Q16799 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTN1Q16799 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTN1Q16799 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTN1Q16799 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RTN1Q16799 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTN1Q16799 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTN1Q16799 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RTN1Q16799 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTN1Q16799 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RTN1Q16799 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTN1Q16799 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RTN1Q16799 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTN1Q16799 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTN1Q16799 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
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