Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAPC1Q16533 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC1Q16533 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms