Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNXAQ16473 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNXAQ16473 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms