Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NTRK3Q16288 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NTRK3Q16288 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NTRK3Q16288 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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