Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCLAFQ15004 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCLAFQ15004 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCLAFQ15004 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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