Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC1AQ14683 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMC1AQ14683 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMC1AQ14683 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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