Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF3Q14653 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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IRF3Q14653 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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IRF3Q14653 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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IRF3Q14653 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF3Q14653 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF3Q14653 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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