Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERV3-1Q14264 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERV3-1Q14264 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERV3-1Q14264 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ERV3-1Q14264 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERV3-1Q14264 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERV3-1Q14264 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERV3-1Q14264 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms