Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCARF1Q14162 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCARF1Q14162 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCARF1Q14162 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms