Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP1Q13835 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PKP1Q13835 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKP1Q13835 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKP1Q13835 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKP1Q13835 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKP1Q13835 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKP1Q13835 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PKP1Q13835 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKP1Q13835 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PKP1Q13835 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKP1Q13835 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKP1Q13835 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKP1Q13835 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKP1Q13835 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKP1Q13835 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PKP1Q13835 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKP1Q13835 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PKP1Q13835 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKP1Q13835 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKP1Q13835 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKP1Q13835 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PKP1Q13835 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKP1Q13835 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PKP1Q13835 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PKP1Q13835 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PKP1Q13835 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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