Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PKD2Q13563 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
PKD2Q13563 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PKD2Q13563 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
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