Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEUROD1Q13562 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NEUROD1Q13562 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEUROD1Q13562 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms