Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC1Q13547 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC1Q13547 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
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