Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB3Q13509 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB3Q13509 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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