Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCIRG1Q13488 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCIRG1Q13488 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCIRG1Q13488 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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