Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLF1Q13351 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF1Q13351 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF1Q13351 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF1Q13351 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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