Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.378e-10■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.158e-10■■■■■ 39.2
PABPC4Q13310 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.191e-10■■■■■ 39.1
PABPC4Q13310 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.258e-8■■■■■ 39.1
PABPC4Q13310 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.958e-8■■■■■ 39.1
PABPC4Q13310 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.91□□□□□ -1.468e-8■■■■■ 39.1
PABPC4Q13310 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 39.1
PABPC4Q13310 RPS19-204ENST00000598399 1172 ntTSL 515.75■□□□□ 0.114e-43■■■■■ 39
PABPC4Q13310 RAB27A-203ENST00000561545 830 ntTSL 324.55■■□□□ 1.527e-7■■■■■ 39
PABPC4Q13310 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 39
PABPC4Q13310 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 39
PABPC4Q13310 RAB27A-204ENST00000563262 702 ntTSL 312.61□□□□□ -0.397e-7■■■■■ 39
PABPC4Q13310 MCOLN1-208ENST00000599334 666 ntTSL 522.39■■□□□ 1.175e-17■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 RPSA-203ENST00000444512 701 ntTSL 222.37■■□□□ 1.175e-33■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 MCOLN1-210ENST00000602227 492 ntTSL 222.36■■□□□ 1.175e-17■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 15e-17■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.85e-17■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 MCOLN1-202ENST00000394321 2253 ntTSL 216.44■□□□□ 0.225e-17■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.645e-9■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 ADD2-203ENST00000403045 3745 ntTSL 210.19□□□□□ -0.785e-9■■■■■ 38.9
PABPC4Q13310 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-323■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-323■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 211.63□□□□□ -0.551e-323■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-323■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-323■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.041e-323■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.051e-323■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.091e-323■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 27.99□□□□□ -1.131e-323■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 PRDX2-203ENST00000466174 1717 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 PRDX2-201ENST00000301522 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 510.75□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 38.8
PABPC4Q13310 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 38.7
PABPC4Q13310 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 38.7
PABPC4Q13310 HDAC5-203ENST00000586339 465 ntTSL 217.18■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 38.7
PABPC4Q13310 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 38.7
PABPC4Q13310 SMG9-210ENST00000600097 538 ntTSL 221.18■□□□□ 0.987e-10■■■■■ 38.7
PABPC4Q13310 LGALS1-203ENST00000454173 331 ntTSL 518.15■□□□□ 0.51e-19■■■■■ 38.7
PABPC4Q13310 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 38.6
PABPC4Q13310 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 38.6
PABPC4Q13310 PEX11B-202ENST00000428634 667 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-10■■■■■ 38.6
PABPC4Q13310 ATP2B1-211ENST00000635033 1358 ntTSL 59.56□□□□□ -0.888e-25■■■■■ 38.6
PABPC4Q13310 NAA10-215ENST00000484950 873 ntTSL 217.49■□□□□ 0.393e-10■■■■■ 38.6
PABPC4Q13310 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.541e-23■■■■■ 38.6
PABPC4Q13310 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.351e-23■■■■■ 38.6
PABPC4Q13310 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.793e-10■■■■■ 38.5
PABPC4Q13310 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)16.49■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 38.5
PABPC4Q13310 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-10■■■■■ 38.5
PABPC4Q13310 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-10■■■■■ 38.5
PABPC4Q13310 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-10■■■■■ 38.5
PABPC4Q13310 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-10■■■■■ 38.5
PABPC4Q13310 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.967e-8■■■■■ 38.5
PABPC4Q13310 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.61e-15■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.331e-15■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 SRI-206ENST00000472930 903 ntTSL 25.03□□□□□ -1.61e-15■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.91e-15■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.04■□□□□ 0.481e-15■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 MRPL47-203ENST00000476781 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 ATP6V0D1-207ENST00000563305 1656 ntTSL 516.83■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 ATP6V0D1-217ENST00000568620 3390 ntTSL 212.99□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 514.54□□□□□ -0.086e-11■■■■■ 38.4
PABPC4Q13310 AK1-206ENST00000550992 574 ntTSL 418.74■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 38.3
PABPC4Q13310 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 38.3
PABPC4Q13310 UBL4A-204ENST00000421431 1652 ntTSL 518.09■□□□□ 0.493e-8■■■■■ 38.3
PABPC4Q13310 AKAP1-209ENST00000572560 442 ntTSL 319.68■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 AKAP1-214ENST00000575032 570 ntTSL 315.44■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 AKAP1-203ENST00000481416 4089 ntTSL 511.06□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.014e-17■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.014e-17■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.826e-9■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.142e-6■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 38.2
PABPC4Q13310 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 LGALS1-207ENST00000489315 516 ntTSL 322.66■■□□□ 1.221e-19■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 LGALS1-205ENST00000472321 546 ntTSL 222.66■■□□□ 1.221e-19■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.14e-15■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 P2RX1-202ENST00000571637 1126 ntTSL 1 (best)25.68■■□□□ 1.73e-7■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 P2RX1-203ENST00000572418 2945 ntTSL 215.44■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.937e-9■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 IL10RB-206ENST00000609556 1341 ntTSL 513.02□□□□□ -0.337e-9■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 IL10RB-207ENST00000637650 2132 ntTSL 56.26□□□□□ -1.417e-9■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 NOP53-206ENST00000598285 265 ntTSL 218.44■□□□□ 0.543e-14■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.591e-323■■■■■ 38.1
PABPC4Q13310 POU2F1-201ENST00000271411 13945 ntTSL 1 (best)7.11□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 38
PABPC4Q13310 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.534e-7■■■■■ 38
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