Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPS1Q13098 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPS1Q13098 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPS1Q13098 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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