Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX4Q12846 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX4Q12846 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
STX4Q12846 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX4Q12846 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX4Q12846 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX4Q12846 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX4Q12846 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX4Q12846 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX4Q12846 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX4Q12846 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX4Q12846 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX4Q12846 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX4Q12846 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX4Q12846 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX4Q12846 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX4Q12846 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX4Q12846 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STX4Q12846 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX4Q12846 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX4Q12846 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX4Q12846 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX4Q12846 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX4Q12846 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX4Q12846 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX4Q12846 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX4Q12846 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX4Q12846 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX4Q12846 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX4Q12846 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX4Q12846 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX4Q12846 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX4Q12846 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX4Q12846 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STX4Q12846 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX4Q12846 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX4Q12846 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX4Q12846 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX4Q12846 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX4Q12846 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STX4Q12846 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX4Q12846 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX4Q12846 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX4Q12846 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX4Q12846 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX4Q12846 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX4Q12846 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX4Q12846 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STX4Q12846 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX4Q12846 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX4Q12846 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX4Q12846 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX4Q12846 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX4Q12846 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX4Q12846 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STX4Q12846 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX4Q12846 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX4Q12846 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX4Q12846 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX4Q12846 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX4Q12846 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX4Q12846 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX4Q12846 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX4Q12846 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX4Q12846 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX4Q12846 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX4Q12846 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX4Q12846 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX4Q12846 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX4Q12846 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX4Q12846 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX4Q12846 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX4Q12846 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
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